特別輸送劇情講述日本人在偽滿洲國設(shè)置細(xì)菌實(shí)驗(yàn)基地的秘密被哈爾濱警察廳督查馮劍白發(fā)現(xiàn)并炸毀的故事。　　哈爾濱發(fā)生的一起離奇命案使得警官馮劍白卷入系列的神秘案件，對于案件的調(diào)查陷入重重的困難中，所以抓到的線索都斷了。　　他所查到的與案件相關(guān)的人劉順、趙秉琪、艾德烈等都相繼死去，馮劍白也受到來自不同政治立場人的威脅，自身的生命都受到威脅。　　馮劍白堅決要追查到底，在關(guān)東軍憲兵隊、東北抗聯(lián)、各國諜報機(jī)構(gòu)的驚心暗戰(zhàn)斗爭中，馮劍白漸漸的揭開謎底。　　在各方的配合幫助下，他們截獲反滿抗日武裝所需要的，正被佐藤偷偷轉(zhuǎn)移中的軍火，粉碎佐藤在哈爾濱進(jìn)行細(xì)菌戰(zhàn)實(shí)驗(yàn)的陰謀。　　日本憲兵隊機(jī)關(guān)和偽滿當(dāng)局根據(jù)七三一部隊要求，經(jīng)常把華中、東北各地的中國人、蘇聯(lián)人、蒙古人和朝鮮人秘密地押送到七三一部隊，供細(xì)菌試驗(yàn)之用。被押送的人大多數(shù)是被俘的八路軍、新四軍、蘇聯(lián)紅軍、地下工作者和反滿抗日的工人、教員、學(xué)生、還有所謂的政治嫌疑犯。在運(yùn)送期間，為防止暴露，日本憲兵隊官方給被押送人員規(guī)定了一個專用名詞："特殊材料""特別輸送"。據(jù)日本憲兵署的文件記載，自從一九三九年起，就有"特別輸送俘虜"之事。日本關(guān)東軍憲兵司令城倉少將于一九三九年發(fā)布過將三十名俘虜"特別輸送"到石井部隊的第二二四號命令。

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